2003年，“国际非辐射性放射保护**”已经提出了现在还在使用的“电磁职业环境指南”，对MRI工作场，测量到的电磁辐射量在防护极限值的100倍以下。TMS的脉冲磁场的较高场强3T与MRI的静态磁场强度相近，并且TMS磁场辐射真正工作时间较短，而且磁场刺激线圈不大，脉冲磁场作用范围随着距离的增加迅速衰减，但从安全性考虑，操作人员应经常与刺激线圈保持0.7m以上的距离。